لغالبية العظمى من المصابين الأوائل بالفيروس كانوا يعملون في سوق لبيع الحيوانات وفواكه البحر في ووهان او انهم قد قاموا بزيارته. من هنا ظهرت الفرضية بأن الفيروس انتقل من الحيوانات إلى البشر, ولكن حتى الآن لم يتم تحديد أي حيوان بالضبط.
حاليًا يتم نقل للعدوى من شخص إلى آخر. يينتقل الفيروس عبر المسالك التنفسية للشخص المريض بالأساس عند العطاس أو السعال. من الممكن ان يتم استنشاق الرذاذ من قبل اشخاص آخرين أو من خلال الهبوط على الأسطح. الاشخاص الذين سيقومون بعد زمن قصير بلمس هذه الأسطح ولاحقًا يقومون بلمس أفواههم, أنوفهم أو عيونهم من الممكن أن يُصابوا بالعدوى. حتى الآن ليس واضحًا لأية درجة المرض معدي, ولكن في هذه المرحلة يبدو بأن درجة العدوى مشابهة على الأقل لتلك التي لفيروس الانفلونزا.
بالاضافة الى ذلك، فانه من الممكن تلقي العدوى من الاشخاص المصابين بالفيروس بدرجة طفيفة